1993年4月东吴证券前身苏州证券公司成立，同年8月正式对外营业。
2002年4月，公司更名为东吴证券有限责任公司，完成增资扩股，募集资金总额8.5亿元。
2010年5月28日，更名为东吴证券股份有限公司。
2011年12月，公司成功登录A股市场，股票代码“601555”，募集资金总额32.5亿元。
2014年8月，东吴证券完成上市后的首次非公开发行，募集资金总额51.31亿元。
2016年1月，东吴证券完成上市后的第二次非公开发行，募集资金总额35.4亿元。
2020年3月，东吴证券以配股公开发行完成上市以来的第三次再融资，募集资金总额59.88亿元。
2022年10月，获得证监会批复的第二批券商科创板做市商资格。